Gmina Nielisz posiada dobrze rozwiniętą infrastrukturę edukacyjną. Na terenie gminy znajdują się 2 szkoły podstawowe: Szkoła  Podstawowa im. Dzieci Zamojszczyzny w Złojcu oraz Szkoła Podstawowa im. Jana Króla w Nieliszu.

Uczniowie tych szkół oprócz standardowych zajęć lekcyjnych uczestniczą w wielu wyjazdach i spotkaniach edukacyjnych oraz biorą udział w kołach zainteresowań, które pozwalają na poszerzanie wiedzy i zdobywanie nagród w wielu konkursach poza gminą.